Biohacker si doma zmapoval vlastní genom pomocí Macu a AI
Biohacker dokázal analyzovat svou DNA přímo v kuchyni. K náročnému projektu mu posloužil Mac Studio, umělá inteligence a kapesní sekvenátor.
Domácí výzkum na poli biologie a genetiky posouvá své hranice. Jeden z technologických nadšenců a biohackerů se na svém blogu pochlubil tím, že se mu přímo na kuchyňském stole podařilo osekvenovat vlastní genom. K tomuto ambicióznímu kutilskému projektu využil osobní počítač Mac Studio s čipem M3 Ultra, umělou inteligenci a volně prodejný, byť mírně specializovaný hardware.
Hlavní motivací k tomuto náročnému pokusu byla rodinná anamnéza a vysoké riziko autoimunitního onemocnění. Jako ústřední nástroj biohacker zvolil kapesní sekvenátor Oxford Nanopore MinION s cenovkou 3 200 dolarů (zhruba 75 000 Kč). Toto zařízení umožňuje jak kompletní sken genomu, tak cílené zkoumání jeho konkrétních částí. S vyhledáním specifických genů souvisejících s obávanou nemocí mu následně pomohl velký jazykový model Claude, který vygeneroval potřebná vstupní data.
Z hlediska výpočetního výkonu proces obstarával výše zmíněný Mac Studio. Autor ovšem poznamenává, že postačí prakticky jakýkoli novější počítač s procesorem Apple Silicon, dostatkem operační paměti a alespoň 100 GB volného místa na disku pro každý jednotlivý běh. Celkové náklady na jeden test se podle něj pohybují kolem 1 100 dolarů (asi 26 000 Kč), a to především kvůli nutnosti kupovat jednorázové průtokové kyvety za 900 dolarů.
Přestože výsledek z kuchyňského stolu pochopitelně nemůže z hlediska rigoróznosti konkurovat klinické diagnostice, ukazuje, kam až se dnes běžně dostupné technologie posunuly. Získaná data lze navíc dále zpracovávat například pomocí specializovaných modelů, jako je AlphaGenome od DeepMindu. Autor na závěr dokonce nabízí osobní konzultace a pomoc dalším případným zájemcům.
